START HERE
open "./START-HERE.command"
Finder 雙擊用；不知道該做什麼時先按這個，它會讀 Operator Pick 並打開目前推薦入口。
No npm script required.
Automation Commands
本地自動化指令面板：哪些會執行流程、哪些只重建視覺頁、哪些是人工或外部可選。
Total71
Available71
Generated2026-08-19T10:59:37.120Z
Daily
雙擊 10:00 閱讀入口
open "./open-daily-brief.command"
Finder 雙擊用；刷新並打開 Daily Brief、workflow 和 OpenWiki。
No npm script required.
open-daily-brief.command daily-brief.html openwiki/quickstart.md
雙擊最近一次自動化收據
open "./open-receipt.command"
Finder 雙擊用；刷新並打開 Automation Receipt，確認最近一次 local/verify/outputs/launchd/UI smoke 是否全綠。
No npm script required.
open-receipt.command automation-receipt.html automation-receipt.json
雙擊執行操作台
open "./open-cockpit.command"
Finder 雙擊用；刷新並打開按鈕式操作台。
No npm script required.
雙擊 Live monitor
open "./open-live-monitor.command"
Finder 雙擊用；持續刷新 automation-live.html，看執行中的 step。
No npm script required.
雙擊一句話決策
open "./open-decision.command"
Finder 雙擊用；刷新並打開 Automation Decision，先判斷現在該做什麼。
No npm script required.
雙擊目前推薦入口
open "./do-recommended.command"
Finder 雙擊用；讀取 Operator Pick，直接打開目前最推薦的 command。
No npm script required.
do-recommended.command automation-entrypoints.html index.html
雙擊同步視覺報表
open "./sync-visuals.command"
Finder 雙擊用；畫面舊掉或 Freshness 有 stale 時使用，只刷新視覺報表與控制台。
No npm script required.
sync-visuals.command automation-visual-sync.html automation-freshness.html index.html
Schedule
剛剛 launchd 失敗後救援
npm --prefix "." run launchd:repair
npm --prefix "." run launchd:test
人在任何 Terminal 位置都可貼；處理 cp launchd/...、Bootstrap failed、Could not find service 後的重裝與完整驗收。
NPM scripts checked: launchd:repair launchd:test
automation-launchd-diagnose.html automation-launchd-test.html automation-live.html
安裝 launchd
npm --prefix "." run launchd:install
把 plist 安裝到 ~/Library/LaunchAgents 並重載。
NPM scripts checked: launchd:install
雙擊安裝 launchd
open "./install-launchd.command"
Finder 雙擊用；安裝、健檢、刷新 readiness 與控制台。
No npm script required.
Launchd 安裝並試跑驗收
npm --prefix "." run launchd:test
安裝 LaunchAgent、立即 kickstart、輪詢到結束，產出 launchd test report。
NPM scripts checked: launchd:test
雙擊安裝並試跑 launchd
open "./install-and-test-launchd.command"
Finder 雙擊用；執行 launchd:test，結束後打開驗收報告、live monitor 與 launchd log。
No npm script required.
install-and-test-launchd.command automation-launchd-test.html automation-live.html automation-launchd.html
修復 launchd
npm --prefix "." run launchd:repair
移除舊服務、重裝 plist、bootstrap、enable 並驗證 service。
NPM scripts checked: launchd:repair
雙擊修復 launchd
open "./repair-launchd.command"
Finder 雙擊用；處理 cp/bootstrap/service not found 後的重裝同步。
No npm script required.
雙擊診斷 launchd
open "./diagnose-launchd.command"
Finder 雙擊用；不重跑 pipeline，只產生 launchd 診斷頁。
No npm script required.
手動觸發 launchd
npm --prefix "." run launchd:kickstart
只送出 launchd 觸發，不等待完整流程結束；完整驗收請用 npm --prefix 的 launchd:test。
NPM scripts checked: launchd:kickstart
雙擊觸發 launchd
open "./kickstart-launchd.command"
Finder 雙擊用；正式走 launchd 觸發並打開 launchd report，但不輪詢到結束。
No npm script required.
檢查 launchd 狀態
npm --prefix "." run launchd:status
查看 service 是否 loaded、last exit code、下次排程。
NPM scripts checked: launchd:status
Run
完整流程 + 驗收
npm --prefix "." run automation:run-and-verify
日常最推薦；跑 local pipeline、verification、health、links、視覺頁。
NPM scripts checked: automation:run-and-verify
快速健檢
npm --prefix "." run automation:check -- "$(npm --prefix "." run -s status:path)"
不重跑 paper pipeline；只驗收現有輸出、視覺頁、連結和下一步。
NPM scripts checked: automation:check status:path
只跑底層 local pipeline
npm --prefix "." run automation:local
排錯用；會輸出 automation-log.json 與 automation-local.html。
NPM scripts checked: automation:local
雙擊完整流程
open "./run-automation.command"
Finder 雙擊用；完成完整 local pipeline 後會接著同步視覺報表，再打開控制台。
No npm script required.
run-automation.command automation-run-and-verify.html automation-visual-sync.html index.html
雙擊快速健檢
open "./check-automation.command"
Finder 雙擊用；完成後打開 Next actions。
No npm script required.
Inspect
Local pipeline 報告
npm --prefix "." run automation:local-html
把 automation-log.json 轉成人可讀的步驟、stdout/stderr 與 slow steps 報告。
NPM scripts checked: automation:local-html
雙擊排錯儀表板
open "./open-debug-dashboard.command"
Finder 雙擊用；刷新並打開 State、Local Pipeline、Run+Verify、Quick Check、Launchd 與診斷頁。
No npm script required.
open-debug-dashboard.command automation-state.html automation-local.html automation-launchd-diagnose.html
控制台
npm --prefix "." run control:center -- "$(npm --prefix "." run -s status:path)"
重建總入口 index.html。
NPM scripts checked: control:center status:path
同步視覺報表
npm --prefix "." run sync:visuals -- "$(npm --prefix "." run -s status:path)"
不跑 paper pipeline；只按依賴順序刷新 dashboard、manifest、operator pick、freshness 與 UI smoke，最後輸出 final convergence。
NPM scripts checked: sync:visuals status:path
automation-visual-sync.html automation-freshness.html index.html
雙擊 Automation manifest
open "./open-automation-manifest.command"
Finder 雙擊用；刷新並打開自動化 source of truth。
No npm script required.
n8n-like 自動化地圖
npm --prefix "." run automation:map -- "$(npm --prefix "." run -s status:path)"
看節點、輸入、輸出、狀態。
NPM scripts checked: automation:map status:path
健康檢查頁
npm --prefix "." run health:html
把 automation-health.json 轉成可讀頁。
NPM scripts checked: health:html
Run + Verify 報告
npm --prefix "." run automation:run-and-verify
此指令會自動產生可讀報告。
NPM scripts checked: automation:run-and-verify
Launchd log 頁
npm --prefix "." run launchd:html
查看排程 stdout/stderr，不觸發流程。
NPM scripts checked: launchd:html
Launchd 診斷頁
npm --prefix "." run launchd:diagnose
檢查 plist 是否存在、是否已安裝、是否同步、service 是否載入，並提供常見錯誤修復指令。
NPM scripts checked: launchd:diagnose
automation-launchd-diagnose.html automation-launchd-diagnose.json
Safe terminal 指令頁
npm --prefix "." run safe:terminal
產生從任何 Terminal 位置都能貼的安全指令，避免從 home 目錄誤跑相對路徑。
NPM scripts checked: safe:terminal
Performance 頁
npm --prefix "." run performance:html
查看最近執行耗時與慢步驟。
NPM scripts checked: performance:html
Links 報告
npm --prefix "." run links:html
把 local link check 結果轉成可讀頁。
NPM scripts checked: links:html
Readiness 判斷頁
npm --prefix "." run readiness:html -- <status.json>
收斂 run+verify、doctor、launchd、links、commands，判斷週四 06:00 是否可放心自動跑。
NPM scripts checked: readiness:html
Schedule 排程頁
npm --prefix "." run schedule:html
顯示下一次週四 06:00、倒數、最近歷史與 launchd 手動入口。
NPM scripts checked: schedule:html
Environment 環境頁
npm --prefix "." run environment:html
顯示 Node/npm 路徑、版本、雙擊 fallback 與 launchd runtime。
NPM scripts checked: environment:html
Overview 總覽頁
npm --prefix "." run overview:html
合併 readiness、schedule、environment、actions、health、verify 與 links。
NPM scripts checked: overview:html
State snapshot 總狀態快照
npm --prefix "." run state:html -- <status.json>
給人與腳本讀的一份總狀態：可否自動跑、哪個 gate 卡住、下一步是什麼。
NPM scripts checked: state:html
Next actions 下一步
npm --prefix "." run next:html -- <status.json>
把目前狀態收斂成 3 到 8 個可操作下一步。
NPM scripts checked: next:html
Automation decision 一句話判斷
npm --prefix "." run decision:html -- <status.json>
回答現在是可交給自動化、需先修、或有高優先人工項目。
NPM scripts checked: decision:html
Execution cockpit 操作台
npm --prefix "." run cockpit:html -- <status.json>
把所有雙擊入口整理成按鈕牆，標明只看、檢查、執行、修復。
NPM scripts checked: cockpit:html
Live monitor
npm --prefix "." run monitor:html
把目前 quick check / local pipeline / run+verify 的 running step 轉成自動刷新頁。
NPM scripts checked: monitor:html
Entry points 入口選擇
npm --prefix "." run entrypoints:html -- <status.json>
比較只看、快速健檢、完整重跑、安裝排程與 kickstart。
NPM scripts checked: entrypoints:html
Operator Pick 解析
npm --prefix "." run operator:pick
把 automation-entrypoints.json 的推薦入口解析成 operator-pick.json；START-HERE.command 也使用同一套邏輯。
NPM scripts checked: operator:pick
目前 status.json 路徑
npm --prefix "." run status:path
解析目前應使用的 status.json：優先最新 run-and-verify / automation-log，最後才退回 fixture。
NPM scripts checked: status:path
automation-current-status.html automation-run-and-verify.json automation-log.json
目前 status.json 視覺報告
npm --prefix "." run status:path:html
把 status.json 解析順序、候選來源與最後選中的檔案做成可讀頁。
NPM scripts checked: status:path:html
automation-current-status.html automation-current-status.json
Capabilities 能力矩陣
npm --prefix "." run capabilities:html -- <status.json>
看目前已建立哪些自動化能力、入口與證據檔。
NPM scripts checked: capabilities:html
Freshness 同步狀態
npm --prefix "." run freshness:html
確認各報告是否同步，避免 overview 或控制台讀到舊 JSON。
NPM scripts checked: freshness:html
Automation manifest
npm --prefix "." run manifest:html -- <status.json>
產生機器可讀與人可讀的正式入口總清單：報告、雙擊檔、npm scripts 與 local-only 邊界。
NPM scripts checked: manifest:html
Automation manifest check
npm --prefix "." run manifest:check
驗證 manifest 裡的報告、雙擊檔、npm scripts 與 local-only 邊界仍可信。
NPM scripts checked: manifest:check
automation-manifest-check.html automation-manifest-check.json
UI smoke 頁
npm --prefix "." run ui:smoke
檢查 Copy 按鈕、 fallback、完整 cd 指令與雙擊入口。
NPM scripts checked: ui:smoke
Research
建立研究專案
npm --prefix "." run research:init -- ortho-literature-review
建立 local-only 研究專案骨架；不呼叫 API。
NPM scripts checked: research:init
產生文獻矩陣
npm --prefix "." run research:matrix -- ortho-literature-review "$(npm --prefix "." run -s status:path)"
把 status.json / paper list 轉成文獻矩陣。
NPM scripts checked: research:matrix status:path
research-projects/ortho-literature-review/matrix/literature-matrix.md
產生主題標籤
npm --prefix "." run research:themes -- ortho-literature-review
從矩陣整理 3-5 個主題標籤與文獻歸類。
NPM scripts checked: research:themes
research-projects/ortho-literature-review/themes/theme-map.md
主題深入分析
npm --prefix "." run research:synthesize -- ortho-literature-review --theme clinical-outcomes
針對單一主題整理共同性、差異性、可能解釋與研究缺口。
NPM scripts checked: research:synthesize
research-projects/ortho-literature-review/synthesis/clinical-outcomes.md
代表性文獻
npm --prefix "." run research:representatives -- ortho-literature-review
依 study type、近期性、臨床重要性排序代表性文獻。
NPM scripts checked: research:representatives
research-projects/ortho-literature-review/representative-papers.md
文獻回顧草稿
npm --prefix "." run research:review-draft -- ortho-literature-review
依主題與論點產出草稿，並同步建立 manuscript-story.md。
NPM scripts checked: research:review-draft
research-projects/ortho-literature-review/review-draft.md research-projects/ortho-literature-review/manuscript-story.md
投稿前自審
npm --prefix "." run research:self-review -- ortho-literature-review
用核心結論、缺口、圖表與寫作檢查題進行人工自審。
NPM scripts checked: research:self-review
研究流程視覺頁
npm --prefix "." run research:map -- ortho-literature-review
產生 research-workflow.html 與 research-dashboard.html。
NPM scripts checked: research:map
Repair
執行前檢查
npm --prefix "." run automation:preflight
檢查 Node/npm、必要檔、權限、local-only 邊界。
NPM scripts checked: automation:preflight
Doctor
npm --prefix "." run automation:doctor -- <status.json>
檢查檔案、launchd、schema、local-only 邊界。
NPM scripts checked: automation:doctor
Local links
npm --prefix "." run links:check
檢查本地 HTML 連結是否存在。
NPM scripts checked: links:check
Local verification
npm --prefix "." run verify:local -- <status.json>
語法、HTML、preflight、doctor、links、schema 一次驗收。
NPM scripts checked: verify:local
Manual
人工待辦
npm --prefix "." run manual:actions -- <status.json>
整理 GPT Pro、wiki review、RAG 等人工缺口。
NPM scripts checked: manual:actions
GPT handoff
npm --prefix "." run gpt:handoff -- <status.json>
產生要貼到 GPT Pro 的 handoff markdown。
NPM scripts checked: gpt:handoff
runs/YYYY-MM-DD/.../gpt-pro-handoff.md
External-off
Notion dry run
npm --prefix "." run notion:dry-run
可選；主流程不自動寫 Notion。
NPM scripts checked: notion:dry-run
no direct output
Notion live sync
npm --prefix "." run notion:sync
需明確確認；不屬於 10:00 前阻塞流程。
NPM scripts checked: notion:sync
no direct output